Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ATP1A4Q13733 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ATP1A4Q13733 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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