Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
EPCAMP16422 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
EPCAMP16422 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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