Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms