Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM5Q9C035 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms