Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC087855.2-201ENST00000518217 537 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HERVK_113Q902F9 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms