Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms