Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RAB6CQ53S08 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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