Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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RTL8BQ17RB0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RTL8BQ17RB0 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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