Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDKN3Q16667 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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