Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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SYCP1Q15431 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SYCP1Q15431 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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