Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CUL1Q13616 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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