Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 TRPV1-207ENST00000572705 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 PRAMEF10-201ENST00000235347 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 PRAMEF33-201ENST00000437300 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 CXorf57-202ENST00000372548 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 AL022323.3-201ENST00000623888 5388 ntBASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 AL161636.1-201ENST00000427145 2254 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 PIWIL3-205ENST00000616349 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 AC092999.1-201ENST00000624004 1924 ntBASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 OPCML-207ENST00000541867 6277 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 OPCML-208ENST00000612177 6250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 HELQ-204ENST00000510985 3315 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
CAMK2BQ13554 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MIR4458HG-203ENST00000606459 3239 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LOXHD1-211ENST00000579038 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 IKZF2-202ENST00000374319 2001 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 A4GNT-201ENST00000236709 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DCTN4-215ENST00000627368 1774 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 OR51I2-201ENST00000341449 1070 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TMEM139-202ENST00000409102 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RN7SKP152-201ENST00000410444 315 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC008781.1-201ENST00000422040 621 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC009501.2-201ENST00000428700 312 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RFTN1P1-201ENST00000442584 1033 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL080317.1-201ENST00000444259 557 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CREB3L2-205ENST00000458726 776 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC020658.1-201ENST00000471253 938 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AF131215.1-201ENST00000488887 520 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 OCIAD1-210ENST00000506801 571 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CHORDC1-207ENST00000530765 564 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AP002892.2-201ENST00000544195 560 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CHCHD3P2-201ENST00000550751 639 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TP53TG3HP-201ENST00000563487 346 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.162-201ENST00000613066 277 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 RFPL3-AS1_1.1-201ENST00000617561 88 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL139093.1-201ENST00000622029 1014 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TFDP3-201ENST00000310125 1680 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AMOTL1-202ENST00000317829 8844 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TLK2P2-201ENST00000414066 2240 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 TRPV1-203ENST00000399759 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC016909.2-201ENST00000424510 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 S100A7A-203ENST00000368729 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 LRRC37A4P-202ENST00000581296 5372 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ATAD1-201ENST00000308448 4640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CAB39L-212ENST00000610540 3692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 ZNF157-201ENST00000377073 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 CSF2RA-209ENST00000432318 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AC010207.1-201ENST00000568384 1946 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
CAMK2BQ13554 AL731563.3-201ENST00000608005 3005 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms