Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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TCIRG1Q13488 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 GAPDHP16-201ENST00000448152 962 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
TCIRG1Q13488 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
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