Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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RFXAPO00287 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RFXAPO00287 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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