Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KDM2AQ9Y2K7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms