Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHORDC1Q9UHD1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms