Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bcl11aQ9QYE3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bcl11aQ9QYE3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms