Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms