Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ropn1lQ9EQ00 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms