Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lsm12Q9D0R8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms