Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smurf1Q9CUN6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smurf1Q9CUN6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms