Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHLHE41Q9C0J9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHLHE41Q9C0J9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms