Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms