Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF396Q96N95 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF396Q96N95 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms