Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC12Q8WUD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC12Q8WUD4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms