Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBE3BQ7Z3V4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms