Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc160Q3UYG1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms