Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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