Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACKR1Q16570 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms