Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TNXAQ16473 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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