Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK4Q16099 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK4Q16099 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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