Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMB3Q13751 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMB3Q13751 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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