Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ECH1Q13011 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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