Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYP4A11Q02928 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms