Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNAP25P60880 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms