Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPB2P35606 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPB2P35606 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPB2P35606 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COPB2P35606 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COPB2P35606 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COPB2P35606 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
COPB2P35606 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPB2P35606 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms