Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMP3P12645 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMP3P12645 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMP3P12645 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BMP3P12645 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BMP3P12645 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BMP3P12645 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms