Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKHD1P08F94 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PKHD1P08F94 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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PKHD1P08F94 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PKHD1P08F94 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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