Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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