Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl3lE9PWZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms