Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms