Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POTEB3A0JP26 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms