Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms