Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 TXNDC9-202ENST00000409434 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL035467.1-201ENST00000403583 686 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL162724.2-201ENST00000426157 308 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFFO1Q0D2I5 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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