Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
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PTPRMP28827 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 OLFML1-201ENST00000329293 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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PTPRMP28827 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPRMP28827 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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