Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
EHD3Q9NZN3 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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