Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
HDDC3Q8N4P3 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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