Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 HNRNPA1P17-201ENST00000496620 924 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 TATDN1-220ENST00000605953 726 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AL357632.1-201ENST00000426688 643 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 CT45A9-202ENST00000620704 1010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
VAX2Q9UIW0 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms