Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LAMTOR2-201ENST00000368302 587 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRDV2-201ENST00000390469 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MRPL52-204ENST00000397505 333 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KRTAP12-3-201ENST00000397907 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL450346.1-201ENST00000403497 559 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR11Q1P-201ENST00000451582 877 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL607P-201ENST00000461220 299 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL503P-201ENST00000475222 303 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC109927.1-203ENST00000507038 421 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CARMN-203ENST00000509909 592 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IDI2-AS1-205ENST00000536039 555 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR4Q1P-201ENST00000557009 904 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AOC4P-204ENST00000569586 565 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC091044.1-201ENST00000591362 375 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KC6-202ENST00000593577 549 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC244517.8-201ENST00000623995 467 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL137798.2-201ENST00000633763 817 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 EGFLAM-203ENST00000354891 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FHL2-207ENST00000409177 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC104667.1-201ENST00000417947 2057 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ADGRG2-204ENST00000357544 4678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LILRB2-205ENST00000434421 2773 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RMND1-201ENST00000336451 1413 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CCDC40-203ENST00000374877 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PAK3-204ENST00000372010 2606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL031666.2-201ENST00000599904 2253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HDAC9-228ENST00000524023 2199 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 EFL1-202ENST00000359445 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PRPSAP2-205ENST00000419071 1491 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GALNT15-206ENST00000617544 2775 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL049775.1-201ENST00000380722 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FAM181A-AS1-202ENST00000554742 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TLR12P-201ENST00000413515 2706 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SMIM23-201ENST00000330910 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FXYD5-204ENST00000392219 872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TUBB8P2-201ENST00000402141 495 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TMEM139-203ENST00000409244 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ING4-203ENST00000412586 741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR11M1P-201ENST00000415975 895 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR14L1P-201ENST00000419087 918 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL355001.1-201ENST00000422148 444 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MTAPP2-201ENST00000437063 832 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms