Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
LINC00587B1AMM8 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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LINC00587B1AMM8 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LINC00587B1AMM8 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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